广安区文庙沟棚户区改造求助

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四川广安市广安区文庙沟棚户区改造。我家的房产证是86年办的，88年国家重新查产权和房屋是否相符，说我家楼上的夹层没上产权，要求把产权补上，然后就开了两张发票，一张是房屋配套费，上面写的是6个多平米，一张是这6个平米的土地使用费。然后房产证就没有换，还是原来的平米。现在改造，拆迁办的人员说，这6个平米层高不足2.2米，不能算，只能按私自搭建赔偿。我就不明白了，以前的老房子又不是现在的楼房，四只角都一样高。而且，国家既然收了钱，那肯定是承认我这个6个平米是合法的，为什么现在拆迁办的不认，求高人指点一下，国家认可的东西，现在拆迁办的不认，该怎么办？